Lenzkirch hat verschiedene Gemeindegremien. Das wichtigste Gremium ist der Gemeinderat. Er ist mit 18 Mitgliedern das Hauptorgan der Gemeinde.

Diese Stellung wird vor allem dadurch gekennzeichnet, dass dem Gemeinderat die kommunalpolitische Führung zukommt, indem er für die Entscheidung der wichtigsten Gemeindeangelegenheiten zuständig ist.

Das zweite Organ ist der Bürgermeister. Er ist gleichzeitig Vorsitzender des Gemeinderates.

Die Ortsteile Kappel und Saig verfügen über einen Ortschaftsrat mit jeweils sechs Mitgliedern. Der Ortschaftsrat ist die bürgerschaftliche Vertretung der jeweiligen örtlichen Gemeinschaft.